我們可以發(fā)現(xiàn)，namd軟件的擴展性依賴于Infiniband網(wǎng)絡(luò)，使用帶寬20Gb，延時小于1.5微秒的Infiniband網(wǎng)路，可以大幅提高軟件并行執(zhí)行效率。
電鏡后處理屬于關(guān)鍵性應用，運行周期長，牽扯上游儀器的使用時間和使用成本，對機器的可靠性和可用性要求高。曙光配置了刀片集群，關(guān)鍵節(jié)點都使用冗余電源、風扇，raid 1 的硬盤策略，存儲節(jié)點使用雙機熱備，存儲使用雙控制器磁盤陣列，從而有效增加系統(tǒng)可靠性和可用性。
方案特點：
關(guān)鍵性
電鏡后處理屬于關(guān)鍵性應用，運行周期長，牽扯上游儀器的使用時間和使用成本，對機器的可靠性和可用性要求高。曙光配置了刀片集群，關(guān)鍵節(jié)點都使用冗余電源、風扇，raid 1 的硬盤策略，存儲節(jié)點使用雙機熱備，存儲使用雙控制器磁盤陣列，從而有效增加系統(tǒng)可靠性和可用性。
規(guī)模比較大
項目規(guī)模比較大，需要具有一定資質(zhì)的系統(tǒng)整體解決方案提供商，從而保證產(chǎn)品的穩(wěn)定性，可靠性，整個系統(tǒng)各項性能的匹配性。
高應用性
針對用戶使用軟件應用的多樣性和復雜性，本方案中曙光推薦使用世界先進的掃描電鏡、刀片集群和SMP胖節(jié)點混合的架構(gòu)，刀片集群可以很好的滿足大部分應用的需求，但是對于一些特別的應用，例如需要更大內(nèi)存帶寬、無法跨節(jié)點并行或跨節(jié)點性能不高的應用，32個計算核心的SMP胖節(jié)點很好的滿足了此類應用。
完善的服務(wù)
曙光是業(yè)內(nèi)唯一的五年原廠商服務(wù)的企業(yè)，能夠幫助用戶真正解決后顧之憂。一整套的解決方案，從前期的安裝，培訓，軟件的編譯、調(diào)優(yōu)，以及設(shè)備到位后的培訓，使用戶不僅僅買到的是一些設(shè)備，而是能夠真正用得好，能為自己的科研工作相助一臂之力的幫手。
方案小結(jié)：
目前，曙光為清華大學醫(yī)學部量身定制的解決方案已經(jīng)部署完畢并且投入正常運營當中。
曙光高性能計算系統(tǒng)平臺作為一個助力現(xiàn)代醫(yī)學開展生命科學研究、開展科研工作的高科技系統(tǒng)平臺，帶來的不僅是高校科研水平的顯著提高，同時完全滿足了用戶對低成本、低功耗、以及高性能計算的全面追求，讓用戶在最大程度上感受到高性能計算技術(shù)的真實價值和綠色功能，從而實現(xiàn)用戶對高穩(wěn)定性、高品質(zhì)服務(wù)的計算系統(tǒng)平臺的追求，也將在更深層次上推動我國醫(yī)學研究行業(yè)和生命科學研究領(lǐng)域的發(fā)展。
