并行計算群的網(wǎng)絡(luò)互連結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)存儲是影響生物信息學(xué)和計算生物學(xué)程序性能的重要因素。通常的服務(wù)器機群采用1000Mb 或10000Mb 以太網(wǎng)互連，只能滿足一般速度要求和任務(wù)并行程序的要求。而浪潮刀片系統(tǒng)則在所有節(jié)點之間都采用了56Gbps的InfiniBand高速互連網(wǎng)絡(luò)，可以和傳統(tǒng)的MPP（大規(guī)模并行處理）計算機媲美，可同時滿足高通量計算和高性能并行計算應(yīng)用的需要。這使得該超級計算機擁有較高的浮點運算性能，是目前蘇州地區(qū)高校性能最高的超算系統(tǒng)。

為便于管理和訪問生物序列數(shù)據(jù)庫，浪潮還將所有計算節(jié)點都通過TSExaStor并行文件系統(tǒng)共享磁盤，并通過高速磁盤陣列確保了高性能計算對于硬盤速度和容量的需求。TSExaStor是浪潮依托“高效能服務(wù)器和存儲技術(shù)國家重點試驗室”，為滿足高性能科學(xué)計算領(lǐng)域?qū)Υ鎯Φ目量桃?，自主研發(fā)的高帶寬、高IOPS的統(tǒng)一存儲系統(tǒng)，完全滿足了Gaussian MP2等計算方法較高IO帶寬要求，也讓整個系統(tǒng)數(shù)以千計的客戶端、服務(wù)器和存儲設(shè)備之間實現(xiàn)了完全并行。同時，元數(shù)據(jù)服務(wù)器和對象數(shù)據(jù)存儲在不同的設(shè)備，兩個對象存儲服務(wù)器采用Actice-Active方式運行。采用多控制器體系架構(gòu)，具有高度安全性的特性；支持PB級容量擴展，全局統(tǒng)一命名空間，性能隨容量的增加而線性提升。浪潮還為并行存儲系統(tǒng)配備了自主開發(fā)的智能化、專用定制化的存儲管理界面，支持圖形化界面顯示，支持圖形化安裝與部署，定制化的備份策略，可選擇備份到其它文件系統(tǒng)，可實現(xiàn)存儲資源的量化和用戶配額制。

同時，集群系統(tǒng)采用浪潮自主開發(fā)的智能化、專用定制化的ClusterEngine超算云服務(wù)平臺，ClusterEngine是專為浪潮天梭系列HPC集群定制的一款軟件，該軟件采用B/S架構(gòu)，通過瀏覽器（IE、Firefox等）進行操作，是一套全面實現(xiàn)了集群的監(jiān)控、管理、資源調(diào)度、報警的軟件，具有更多人性化功能，可以更快的構(gòu)建系統(tǒng)、完善應(yīng)用系統(tǒng)、強化管理系統(tǒng)，提升整體集群的使用效果，提升應(yīng)用效率。

除了上述之外，浪潮還提供了獨具特色的應(yīng)用特征分析軟件天眼及行業(yè)領(lǐng)先的應(yīng)用調(diào)優(yōu)服務(wù)體系，幫助蘇大放射醫(yī)學(xué)院解決應(yīng)用瓶頸和計算程序算法二次開發(fā)熱點分析服務(wù)。

蘇大放射醫(yī)學(xué)院高性能計算平臺負(fù)責(zé)人表示，“浪潮在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的專業(yè)應(yīng)用調(diào)優(yōu)服務(wù)和豐富的異構(gòu)架構(gòu)的應(yīng)用移植經(jīng)驗是我們選擇浪潮的原因所在?！彼麑顺碧煅塾∠笊羁蹋J(rèn)為它在計算、IO、網(wǎng)絡(luò)、內(nèi)存四個維度的基礎(chǔ)上細化出包括實時內(nèi)存讀取帶寬在內(nèi)的40余項應(yīng)用特征指標(biāo)，實現(xiàn)了對軟件應(yīng)用的特征更為精確的量化刻畫和分析，能夠方便地察看任務(wù)負(fù)載、CPU利用率、網(wǎng)絡(luò)、內(nèi)存、存儲的使用情況以及當(dāng)前系統(tǒng)整體運行狀態(tài)或單個節(jié)點的運行狀態(tài)。而且當(dāng)對天眼工具分析的結(jié)果疑惑時，浪潮應(yīng)用團隊可以提供專業(yè)的分析和定位服務(wù)，“這種專業(yè)增值服務(wù)很好的解決了我們的后顧之憂，讓整個研究團隊可以專注于科學(xué)研究之中?！?/p>

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