Intel xeon 雙路四核刀片服務器CB60-G采用了Intel 5500系列高端芯片組,7U空間里可容納80個計算核心,并且總體計算核心數(shù)為288個,其高效能的配置足以支撐醫(yī)療行業(yè)用戶的高速計算需求。同時在擴展方面為升級提供了很大的空間,能夠滿足日后發(fā)展壯大的需求。

32片曙光刀片和1臺smp胖節(jié)點作為計算節(jié)點,1片曙光雙路刀片作為登陸管理節(jié)點,7片曙光2路節(jié)點作為I/O節(jié)點。曙光刀片平臺良好的兼容性能夠在滿足醫(yī)療用戶需求的前提下,最大限度地整合資源,節(jié)約空間,減少布線,降低成本。同時,曙光刀片網(wǎng)絡,Infiniband設備的模塊化設計也為用戶最大限度提高了性能,節(jié)約了成本。

曙光病原生物學大型計算平臺應用醫(yī)療研究領(lǐng)域特點

由于中國醫(yī)療研究領(lǐng)域的不斷發(fā)展,醫(yī)療生物、病原研究等工作顯得極其迫切,高存儲的需求空間也成為重要的建設方面,曙光設計的病原生物學大型計算平臺充分考慮到了應用特點。因此在存儲方面使用了目前業(yè)界容量最大的SATA磁盤陣列,存儲容量達到64TB。同時使用專門為曙光刀片平臺所設計的Infiniband高速模塊,充分降低了交換機成本,大幅降低Infiniband高速網(wǎng)成本和布線,同時保證所有節(jié)點之前Infiniband全線速互聯(lián)。

類似中國醫(yī)學科學院病原生物學研究所的醫(yī)療研究專業(yè)機構(gòu),所從事的均是高密度、高技術(shù)的專向研究?;谟⑻貭栔翉娞幚砥鞯牡氖锕獠≡飳W大型計算平臺可保證病原研究平臺穩(wěn)定可靠的運行,有效避免因系統(tǒng)故障而導致超算平臺效率下降。同時可極大提高原有計算模式的速度,保障中國醫(yī)療研究行業(yè)學科研究的應用,增強各醫(yī)療機構(gòu)科研方面的核心競爭力。

計算平臺內(nèi)含的VMD分子圖形軟件,可以用來顯示、模擬動畫和分析生物分子和無機小分子。支持近20種生物和量化軟件的60種文件格式,功能非常強大。開放的眾多插件可以實現(xiàn)多種功能,內(nèi)置的數(shù)目眾多的TCL函數(shù)庫可以方便的進行程序的二次開發(fā),研究者可以根據(jù)自己的需要編程進行結(jié)果的分析。VMD通過內(nèi)置的IMD的功能可以實現(xiàn)與NAMD模擬的無縫對接,實現(xiàn)對生物分子和無機小份子的把控。

曙光病原生物學大型計算平臺的意義

曙光病原生物學大型計算平臺作為一個助力現(xiàn)代醫(yī)學研究信息化建設、科研工作的高科技平臺,它帶來的不僅是運行效率的顯著提升,同時也完全滿足了類似病原所等研究機構(gòu)對更高計算性能和更低成本的追求,讓用戶在最大程度上感受到高性能計算技術(shù)的真實價值,從而實現(xiàn)穩(wěn)定、高品質(zhì)的服務,也將在更深層次上推動我國醫(yī)學研究行業(yè)高性能計算系統(tǒng)的建設,讓中國的醫(yī)療事業(yè)發(fā)展在高性能計算平臺上揚帆起航。

曙光病原生物學大型計算平臺的成功使用是曙光長期致力于高性能計算普及應用的又一重大成果,不但驗證了擁有刀片服務器自主知識產(chǎn)權(quán)的曙光公司的創(chuàng)新能力,而且大大加強了曙光公司的國際影響力。

關(guān)于曙光:

公司是一家在科技部、信息產(chǎn)業(yè)部、中科院大力推動下,以國家"863"計劃重大科研成果為基礎組建的高新技術(shù)企業(yè)。它以中科院計算所、國家智能計算機研究開發(fā)中心和國家高性能計算機工程中心為技術(shù)依托,擁有強大的技術(shù)實力。曙光系列產(chǎn)品的問世,為推動我國高性能計算機的發(fā)展做出了不可磨滅的貢獻。2008年6月,每秒運算233萬億次的超級計算機曙光5000A研制成功,于同年進入全球超級計算機TOP500排行榜前十名,成為美國之外速度最快的計算機,從而使中國成為繼美國之后,第二個能研制百萬億次高性能計算機的國家。

2006年7月,占地面積60余畝的曙光天津產(chǎn)業(yè)基地落成投產(chǎn),實現(xiàn)民族高性能計算機產(chǎn)業(yè)的歷史跨越。曙光高性能計算機連續(xù)13年穩(wěn)居國產(chǎn)高性能計算機市場第一,擁有國產(chǎn)高性能70%以上的份額,并在高性能集群領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)了國產(chǎn)機對進口產(chǎn)品的超越。曙光公司生產(chǎn)的系列服務器以技術(shù)先進、性能卓越、服務優(yōu)良見長,曾獲"國家科技進步一等獎、二等獎"、"中科院科技創(chuàng)新特等獎"、"2001、2003、2004中國十大科技進展"等多項國家級殊榮。

長期以來,曙光始終專注于服務器領(lǐng)域的研發(fā)、生產(chǎn)與應用,依托超級計算機的扎實功底,立足自主研發(fā),通過不斷技術(shù)創(chuàng)新,構(gòu)建出擁有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的全系列精品服務器,能全面滿足用戶從超級計算機到普通PC服務器的各項應用需求,在互聯(lián)網(wǎng)、金融、電信、生物、氣象、石油、科研、電力等多個行業(yè)有著大量成功應用。

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