32片曙光刀片和1臺(tái)smp胖節(jié)點(diǎn)作為計(jì)算節(jié)點(diǎn)，1片曙光雙路刀片作為登陸管理節(jié)點(diǎn)，7片曙光2路節(jié)點(diǎn)作為I/O節(jié)點(diǎn)。曙光刀片平臺(tái)良好的兼容性能夠在滿足醫(yī)療用戶需求的前提下，最大限度地整合資源，節(jié)約空間，減少布線，降低成本。同時(shí)，曙光刀片網(wǎng)絡(luò)，Infiniband設(shè)備的模塊化設(shè)計(jì)也為用戶最大限度提高了性能，節(jié)約了成本。

曙光病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)應(yīng)用醫(yī)療研究領(lǐng)域特點(diǎn)

由于中國(guó)醫(yī)療研究領(lǐng)域的不斷發(fā)展，醫(yī)療生物、病原研究等工作顯得極其迫切，高存儲(chǔ)的需求空間也成為重要的建設(shè)方面，曙光設(shè)計(jì)的病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)充分考慮到了應(yīng)用特點(diǎn)。因此在存儲(chǔ)方面使用了目前業(yè)界容量最大的SATA磁盤(pán)陣列，存儲(chǔ)容量達(dá)到64TB。同時(shí)使用專(zhuān)門(mén)為曙光刀片平臺(tái)所設(shè)計(jì)的Infiniband高速模塊，充分降低了交換機(jī)成本，大幅降低Infiniband高速網(wǎng)成本和布線，同時(shí)保證所有節(jié)點(diǎn)之前Infiniband全線速互聯(lián)。

類(lèi)似中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所的醫(yī)療研究專(zhuān)業(yè)機(jī)構(gòu)，所從事的均是高密度、高技術(shù)的專(zhuān)向研究?；谟⑻貭栔翉?qiáng)處理器的的曙光病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)可保證病原研究平臺(tái)穩(wěn)定可靠的運(yùn)行，有效避免因系統(tǒng)故障而導(dǎo)致超算平臺(tái)效率下降。同時(shí)可極大提高原有計(jì)算模式的速度，保障中國(guó)醫(yī)療研究行業(yè)學(xué)科研究的應(yīng)用，增強(qiáng)各醫(yī)療機(jī)構(gòu)科研方面的核心競(jìng)爭(zhēng)力。

計(jì)算平臺(tái)內(nèi)含的VMD分子圖形軟件，可以用來(lái)顯示、模擬動(dòng)畫(huà)和分析生物分子和無(wú)機(jī)小分子。支持近20種生物和量化軟件的60種文件格式，功能非常強(qiáng)大。開(kāi)放的眾多插件可以實(shí)現(xiàn)多種功能，內(nèi)置的數(shù)目眾多的TCL函數(shù)庫(kù)可以方便的進(jìn)行程序的二次開(kāi)發(fā)，研究者可以根據(jù)自己的需要編程進(jìn)行結(jié)果的分析。VMD通過(guò)內(nèi)置的IMD的功能可以實(shí)現(xiàn)與NAMD模擬的無(wú)縫對(duì)接，實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子和無(wú)機(jī)小份子的把控。

曙光病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)的意義

曙光病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)作為一個(gè)助力現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究信息化建設(shè)、科研工作的高科技平臺(tái)，它帶來(lái)的不僅是運(yùn)行效率的顯著提升，同時(shí)也完全滿足了類(lèi)似病原所等研究機(jī)構(gòu)對(duì)更高計(jì)算性能和更低成本的追求，讓用戶在最大程度上感受到高性能計(jì)算技術(shù)的真實(shí)價(jià)值，從而實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定、高品質(zhì)的服務(wù)，也將在更深層次上推動(dòng)我國(guó)醫(yī)學(xué)研究行業(yè)高性能計(jì)算系統(tǒng)的建設(shè)，讓中國(guó)的醫(yī)療事業(yè)發(fā)展在高性能計(jì)算平臺(tái)上揚(yáng)帆起航。

曙光病原生物學(xué)大型計(jì)算平臺(tái)的成功使用是曙光長(zhǎng)期致力于高性能計(jì)算普及應(yīng)用的又一重大成果，不但驗(yàn)證了擁有刀片服務(wù)器自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的曙光公司的創(chuàng)新能力，而且大大加強(qiáng)了曙光公司的國(guó)際影響力。

關(guān)于曙光：

公司是一家在科技部、信息產(chǎn)業(yè)部、中科院大力推動(dòng)下，以國(guó)家"863"計(jì)劃重大科研成果為基礎(chǔ)組建的高新技術(shù)企業(yè)。它以中科院計(jì)算所、國(guó)家智能計(jì)算機(jī)研究開(kāi)發(fā)中心和國(guó)家高性能計(jì)算機(jī)工程中心為技術(shù)依托，擁有強(qiáng)大的技術(shù)實(shí)力。曙光系列產(chǎn)品的問(wèn)世，為推動(dòng)我國(guó)高性能計(jì)算機(jī)的發(fā)展做出了不可磨滅的貢獻(xiàn)。2008年6月，每秒運(yùn)算233萬(wàn)億次的超級(jí)計(jì)算機(jī)曙光5000A研制成功，于同年進(jìn)入全球超級(jí)計(jì)算機(jī)TOP500排行榜前十名，成為美國(guó)之外速度最快的計(jì)算機(jī)，從而使中國(guó)成為繼美國(guó)之后，第二個(gè)能研制百萬(wàn)億次高性能計(jì)算機(jī)的國(guó)家。

2006年7月，占地面積60余畝的曙光天津產(chǎn)業(yè)基地落成投產(chǎn)，實(shí)現(xiàn)民族高性能計(jì)算機(jī)產(chǎn)業(yè)的歷史跨越。曙光高性能計(jì)算機(jī)連續(xù)13年穩(wěn)居國(guó)產(chǎn)高性能計(jì)算機(jī)市場(chǎng)第一，擁有國(guó)產(chǎn)高性能70%以上的份額，并在高性能集群領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)了國(guó)產(chǎn)機(jī)對(duì)進(jìn)口產(chǎn)品的超越。曙光公司生產(chǎn)的系列服務(wù)器以技術(shù)先進(jìn)、性能卓越、服務(wù)優(yōu)良見(jiàn)長(zhǎng)，曾獲"國(guó)家科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、二等獎(jiǎng)"、"中科院科技創(chuàng)新特等獎(jiǎng)"、"2001、2003、2004中國(guó)十大科技進(jìn)展"等多項(xiàng)國(guó)家級(jí)殊榮。

長(zhǎng)期以來(lái)，曙光始終專(zhuān)注于服務(wù)器領(lǐng)域的研發(fā)、生產(chǎn)與應(yīng)用，依托超級(jí)計(jì)算機(jī)的扎實(shí)功底，立足自主研發(fā)，通過(guò)不斷技術(shù)創(chuàng)新，構(gòu)建出擁有完全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的全系列精品服務(wù)器，能全面滿足用戶從超級(jí)計(jì)算機(jī)到普通PC服務(wù)器的各項(xiàng)應(yīng)用需求，在互聯(lián)網(wǎng)、金融、電信、生物、氣象、石油、科研、電力等多個(gè)行業(yè)有著大量成功應(yīng)用。

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