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曙光TC3600助力中科院計(jì)算所生命科學(xué)項(xiàng)目研究

DoSERV.com 發(fā)表于:11年03月09日 14:52 [來稿] DOIT.com.cn

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[導(dǎo)讀]生命科學(xué)是21世紀(jì)最重要的科學(xué)分支之一,人類在生命科學(xué)研究的投入隨著人類文明與社會(huì)科學(xué)的發(fā)展正在逐步增加。
生命科學(xué)是21世紀(jì)最重要的科學(xué)分支之一,人類在生命科學(xué)研究的投入隨著人類文明與社會(huì)科學(xué)的發(fā)展正在逐步增加。作為科學(xué)研究領(lǐng)域的重要組成部分,生命科學(xué)研究占據(jù)了重要的核心部分。
    
中科院作為國家在科學(xué)技術(shù)方面的最高學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)和全國自然科學(xué)與高新技術(shù)的綜合研究與發(fā)展中心,近年來為國家文明的發(fā)展做出了重要貢獻(xiàn)。此次中科院計(jì)算所高性能計(jì)算中心的生命科學(xué)研究項(xiàng)目,正是為了進(jìn)一步推動(dòng)國家對于生命科學(xué)研究的認(rèn)知與理解。面對龐大的研究對象和復(fù)雜的基因內(nèi)在聯(lián)系,高性能計(jì)算在生命科學(xué)的研究和發(fā)展中起到了重要的作用。
    
近年來,由于測序技術(shù)的飛速發(fā)展,人類發(fā)現(xiàn)的基因序列數(shù)目按照指數(shù)級增長。面對數(shù)量龐大的基因進(jìn)行同源性搜尋,比對,分析,遺傳發(fā)育分析等等,巨大的數(shù)據(jù)處理量和并行計(jì)算量則也是如影隨形。同時(shí),由于生命科學(xué)的研究對象往往是蛋白質(zhì)和DNA的大分子,對這些分子的三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測,動(dòng)力學(xué)特性、熱力學(xué)特性、在生命過程中如何發(fā)生作用,而這些科學(xué)問題更是要借助于高性能計(jì)算機(jī)。所以高性能計(jì)算機(jī)在生命科學(xué)研究中,應(yīng)用非常廣泛,扮演著極其重要的角色。
    
曙光有著龐大應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)以及豐富產(chǎn)品線的高端科技廠商,其所研發(fā)的系列服務(wù)器產(chǎn)品在國內(nèi)受到了各行各業(yè)的普遍認(rèn)可。曙光的高性能計(jì)算技術(shù)在不斷的應(yīng)用中喚起了更多國內(nèi)用戶對于高性能計(jì)算技術(shù)的認(rèn)知,為中國高性能計(jì)算的發(fā)展壯大與普及奠定了重要的基礎(chǔ)。
    
據(jù)了解,此次的核心應(yīng)用服務(wù)器產(chǎn)品是曙光TC3600刀片服務(wù)器系統(tǒng),該系統(tǒng)不僅是全球首款符合SSI標(biāo)準(zhǔn)可實(shí)現(xiàn)全面兼容的刀片服務(wù)器系統(tǒng),還是標(biāo)志了中國高性能計(jì)算最高成就的星云系統(tǒng)的核心部件。
    
業(yè)界人士介紹,曙光TC3600不僅擁有強(qiáng)大靈活的網(wǎng)絡(luò)和I/O擴(kuò)展能力、強(qiáng)大的計(jì)算能力、綠色節(jié)能、高效智能的電源策略和散熱策略等眾多高效性優(yōu)勢,還融入了諸多先進(jìn)的設(shè)計(jì)理念和技術(shù)特性,是業(yè)界當(dāng)之無愧的最新一代刀片服務(wù)器產(chǎn)品。
    
曙光TC3600總共擁有10個(gè)計(jì)算刀片,并且擁有曙光自行研發(fā)的彈性存儲(chǔ)模塊,最大單刀片可以使用12塊2.5寸硬盤,并且擁有4個(gè)大功率冗余電源,支持N+1和N+N等方式冗余。同時(shí),該刀片系統(tǒng)為每個(gè)計(jì)算單元配備了兩顆四核Intel Xeon處理器,擁有96GB的內(nèi)存,可支持符合SSI標(biāo)準(zhǔn)的高速模塊、低速模塊、IB子卡和管理模塊。
    
在系統(tǒng)的關(guān)鍵部件和功能模塊,TC3600還采用了冗余設(shè)計(jì),可實(shí)現(xiàn)企業(yè)級的RAS特性,滿足關(guān)鍵應(yīng)用的需求。其所具備的良好的系統(tǒng)可伸縮性,可根據(jù)需求實(shí)現(xiàn)靈活的按需配置。通過IO Blade實(shí)現(xiàn)IO擴(kuò)展,可為計(jì)算刀片提供更多的磁盤和標(biāo)準(zhǔn)PCI-E接口;系統(tǒng)可支持40Gb的Infiniband QDR網(wǎng)絡(luò),10Gb 以太網(wǎng)絡(luò)和1Gb以太網(wǎng)絡(luò),4Gb/8Gb FC網(wǎng)絡(luò);同時(shí)配置存儲(chǔ)模塊,可實(shí)現(xiàn)10塊磁盤的擴(kuò)展,并靈活分配給各個(gè)計(jì)算刀片。
    
作為全球第一款符合SSI的開放性標(biāo)準(zhǔn)的刀片服務(wù)器系統(tǒng),TC3600刀片服務(wù)器不僅以開放性標(biāo)準(zhǔn)打破了壟斷和“孤島”,為形成產(chǎn)業(yè)鏈提供了前提條件,而且為用戶獲得更多的產(chǎn)品選擇和完善服務(wù),降低TCO等提供了保障。 TC3600刀片服務(wù)器不僅能夠?qū)崿F(xiàn)高性能、高密度、可伸縮、按需配置、方案靈活的產(chǎn)品設(shè)計(jì),而且可滿足用戶多樣且動(dòng)態(tài)變化的應(yīng)用需求。其具有企業(yè)級產(chǎn)品的RAS特性,可完全滿足政府、電信、金融、教育、互聯(lián)網(wǎng)等關(guān)鍵用戶的需要。
    
曙光TC3600入駐中科院計(jì)算所高性能計(jì)算中心生命科學(xué)研究項(xiàng)目,可有效提升計(jì)算中心系統(tǒng)的計(jì)算能力、高性能、高可靠性以及綠色節(jié)能等。將為降低系統(tǒng)功耗,提高系統(tǒng)電源效率和制冷效率提供重要支持。
    
此次應(yīng)用于生命科學(xué)研究項(xiàng)目,必將為項(xiàng)目的順利展開以及開拓更加龐大的計(jì)算能力起到重要的作用。其靈活擴(kuò)展能力、強(qiáng)大計(jì)算能力、高性能、高可靠性以及綠色節(jié)能產(chǎn)品等特性,也將進(jìn)一步助力中科院計(jì)算所高性能計(jì)算中心實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)提升和節(jié)能低碳的目標(biāo)。
   
[責(zé)任編輯:査彬]
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