ASC25超算大賽總決賽舉辦地青海大學(xué)

在進(jìn)入ASC25總決賽的隊(duì)伍中,浙江大學(xué)隊(duì)對超算領(lǐng)域的知識體系和技術(shù)架構(gòu)有著深入理解,在精準(zhǔn)剖析賽題應(yīng)用性能瓶頸的基礎(chǔ)上,采用了創(chuàng)新優(yōu)化方法并取得了顯著成效,在各道賽題上均表現(xiàn)優(yōu)異,總成績位列預(yù)賽第一名。

決賽隊(duì)伍名單上,還有上屆ASC冠亞軍北京大學(xué)和中山大學(xué),以及清華大學(xué)、上海交通大學(xué)、德國埃爾朗根-紐倫堡大學(xué)等強(qiáng)隊(duì)。此外,ASC25總決賽繼續(xù)涌現(xiàn)新力量新面孔,南京大學(xué)、北京師范大學(xué)、北京郵電大學(xué)、南非金山大學(xué)、臺灣大學(xué)均為首次晉級ASC決賽。老牌勁旅和實(shí)力新秀盡數(shù)入陣,將使得總決賽的爭奪更加激烈,各項(xiàng)大獎最終歸屬充滿懸念。

ASC25預(yù)賽賽題包括RNA甲基化修飾位點(diǎn)檢測與AlphaFold3推理優(yōu)化,這兩大賽題聚焦前沿科學(xué)領(lǐng)域的高性能計(jì)算和人工智能的融合。部分參賽隊(duì)伍對業(yè)界的優(yōu)化算法進(jìn)行了充分的調(diào)研分析,并結(jié)合軟硬件環(huán)境創(chuàng)新性提出了最佳優(yōu)化方法,最大程度上發(fā)揮出平臺的計(jì)算性能。他們在超算應(yīng)用分析、性能優(yōu)化、并行策略設(shè)計(jì)等方面展現(xiàn)出超強(qiáng)學(xué)習(xí)能力和實(shí)踐能力。

RNA賽題要求對mRNA上的“5-甲基胞嘧啶”(m5C)的修飾位點(diǎn)檢測流程進(jìn)行性能優(yōu)化,參賽隊(duì)伍需要梳理流程操作步驟、構(gòu)建流程軟件環(huán)境,并完成對三個數(shù)據(jù)集約3億4千萬條測序數(shù)據(jù)的處理,在保證結(jié)果正確的基礎(chǔ)上,最大化優(yōu)化流程性能。浙江大學(xué)隊(duì)展現(xiàn)出出眾的技術(shù)實(shí)力和創(chuàng)新思維。他們采用數(shù)據(jù)并行策略,對流程核心應(yīng)用程序hisat-3n-table進(jìn)行深度重構(gòu),程序性能提升11倍。同時,他們使用C++重寫了JAVA程序,以提升其內(nèi)存效率和IO性能,實(shí)現(xiàn)性能提升6.6倍。通過這兩項(xiàng)關(guān)鍵優(yōu)化,流程性能整體表現(xiàn)極為出色。

AlphaFold3推理優(yōu)化賽題要求對AlphaFold3的結(jié)構(gòu)預(yù)測代碼進(jìn)行優(yōu)化,并需要將代碼從GPU平臺移植到CPU平臺優(yōu)化運(yùn)行。參賽隊(duì)需要在確保預(yù)測精度的前提下,對組委會指定的12組蛋白質(zhì)序列實(shí)現(xiàn)高效推理。北京大學(xué)隊(duì)基于xFold將代碼移植到PyTorch上,針對GPU進(jìn)行了編譯優(yōu)化,減少了非必要的數(shù)據(jù)填充,并根據(jù)序列長度靈活選擇更高效的計(jì)算方式,使性能相比原始PyTorch版本提升了2.44倍;在CPU優(yōu)化方面,他們通過算子融合提升計(jì)算效率,減少數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)化,并借助AMX技術(shù),整體將推理速度提升14.5倍,在該賽題上取得優(yōu)異成績。

ASC世界大學(xué)生超級計(jì)算機(jī)競賽(ASC Student Supercomputer Challenge)由中國發(fā)起組織,并得到亞洲及歐美相關(guān)專家和機(jī)構(gòu)支持,旨在通過大賽平臺推動各國及地區(qū)間超算青年人才交流和培養(yǎng),提升超算應(yīng)用水平和研發(fā)能力,發(fā)揮超算的科技驅(qū)動力,促進(jìn)科技與產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新。ASC超算大賽迄今已舉行至第十二屆,吸引來自全球六大洲上萬名大學(xué)生報名參賽,是全球最大規(guī)模的大學(xué)生超算競賽。

ASC25總決賽隊(duì)伍名單如下:

浙江大學(xué)

國防科技大學(xué)

北京航空航天大學(xué)

中山大學(xué)

上海大學(xué)

中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)

北京大學(xué)

齊魯工業(yè)大學(xué)

華中科技大學(xué)

西北工業(yè)大學(xué)

蘭州大學(xué)

南京大學(xué)

北京師范大學(xué)

清華大學(xué)

上海交通大學(xué)

福州大學(xué)

北京郵電大學(xué)

青海大學(xué)

金山大學(xué)(南非)

臺灣清華大學(xué)

埃爾朗根-紐倫堡大學(xué)(德國)

臺灣大學(xué)

泰國農(nóng)業(yè)大學(xué)(泰國)

澳門科技大學(xué)

EAFIT大學(xué)(哥倫比亞)

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lixiangjing

算力豹主編

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