(三) 內(nèi)部結(jié)構(gòu)

PHPC 100共包括五個(gè)計(jì)算模塊，第一個(gè)模塊為計(jì)算兼管理模塊，其余4個(gè)為純計(jì)算模塊。每個(gè)模塊包括2顆最新的AMD Opteron 2000系列四核處理器。
計(jì)算模塊直接通過(guò)20Gb Infiniband高性能網(wǎng)絡(luò)和千兆以太網(wǎng)進(jìn)行互聯(lián)。

千兆以太網(wǎng)：

千兆以太網(wǎng)作為PHPC 100的管理網(wǎng)絡(luò)。每臺(tái)PHPC 100標(biāo)配一個(gè)千兆以太網(wǎng)交換模塊，最大支持兩個(gè)一個(gè)千兆以太網(wǎng)交換模塊。同時(shí)PHPC 100中每個(gè)計(jì)算模塊提供兩個(gè)千兆以太網(wǎng)接口，分別和兩個(gè)千兆以太網(wǎng)交換模塊相連接。

每個(gè)千兆以太網(wǎng)交換模塊對(duì)內(nèi)分別和5個(gè)計(jì)算模塊的千兆以太網(wǎng)接口相連接，對(duì)外提供四個(gè)千兆以太網(wǎng)接口。

Infiniband網(wǎng)：

在PHPC 100中，專(zhuān)為高性能計(jì)算設(shè)計(jì)了一套高性能的計(jì)算網(wǎng)絡(luò)—Infiniband網(wǎng)絡(luò)。該IB網(wǎng)絡(luò)采用了最新的Connect X（第三代IB芯片）技術(shù)，點(diǎn)到點(diǎn)的單向帶寬為20Gb/s，延遲為1.26us。是一套高帶寬、低延遲、全交換、無(wú)阻塞網(wǎng)絡(luò)。

在PHPC 100中，每一個(gè)計(jì)算模塊都配置了一塊DDR IB網(wǎng)卡（20Gb/s），同時(shí)集成了一塊IB交換芯片，對(duì)外提供10個(gè)20Gb/s的IB接口。
硬件管理模塊：

PHPC 100標(biāo)配一個(gè)硬件管理模塊，最大支持兩個(gè)。當(dāng)配置兩個(gè)時(shí)，可實(shí)現(xiàn)兩個(gè)模塊之間的冗余。

硬件管理模塊內(nèi)置曙光個(gè)人高性能計(jì)算機(jī)管理軟件，可實(shí)現(xiàn)共享USB 功能、KVM 切換、計(jì)算模塊狀態(tài)、故障定位、開(kāi)關(guān)機(jī)等全方位管理控制監(jiān)視功能。用戶(hù)可以通過(guò)管理模塊上的以太網(wǎng)接口，在遠(yuǎn)程實(shí)現(xiàn)對(duì)PHPC 100的管理和監(jiān)控。

另外，硬件管理模塊內(nèi)集成了視頻切換功能（KVM），用戶(hù)在本地或遠(yuǎn)程，實(shí)現(xiàn)對(duì)PHPC 100中各個(gè)計(jì)算模塊的視頻管理。

(四)軟件

PHPC 100內(nèi)集成一系列的軟件，包括曙光個(gè)人高性能計(jì)算機(jī)管理軟件、操作系統(tǒng)、曙光集群管理監(jiān)控軟件、高性能計(jì)算系統(tǒng)平臺(tái)軟件和部分高性能計(jì)算應(yīng)用軟件。

曙光個(gè)人高性能計(jì)算機(jī)管理軟件：

曙光個(gè)人高性能計(jì)算機(jī)管理軟件集成在硬件管理模塊中，實(shí)現(xiàn)對(duì)PHPC 100硬件的全方位管理和監(jiān)控，包括開(kāi)關(guān)機(jī)、開(kāi)關(guān)計(jì)算模塊、各個(gè)模塊的溫度的監(jiān)控、計(jì)算模塊狀態(tài)監(jiān)控和故障定位、風(fēng)扇的管理、千兆交換模塊的管理和監(jiān)控等等。通過(guò)該軟件，用戶(hù)可以在本地或通過(guò)軟件實(shí)現(xiàn)對(duì)PHPC 100的硬件層面的管理和監(jiān)控。

操作系統(tǒng)：

PHPC 100支持WCCS2003、SuSE Linux、RedhatLinux、CentOS等主流操作系統(tǒng)。標(biāo)配WCCS 2003和CentOS操作系統(tǒng)，出廠(chǎng)安裝WCCS 2003。

曙光集群管理監(jiān)控軟件：

PHPC 100集成了曙光最新的集群管理監(jiān)控系統(tǒng)-GridView。

曙光新一代GridView集群綜合管理系統(tǒng)提供統(tǒng)一的集中式監(jiān)控平臺(tái)，具備可擴(kuò)展性、集成性、可靠性和易用性，提供對(duì)各種商用、自己研發(fā)的管理工具的集成接口，包括直接以Portal的方式集成和抽取各已有管理工具的監(jiān)控?cái)?shù)據(jù)以便上層平臺(tái)能夠分析利用，完成對(duì)高性能計(jì)算機(jī)的環(huán)境、硬件、軟件等各方面進(jìn)行監(jiān)控的需求。

系統(tǒng)具有易用性，提供簡(jiǎn)單靈活的系統(tǒng)部署，人性化的界面和功能設(shè)計(jì)，方便最終用戶(hù)的使用，包括靈活方便的個(gè)性化設(shè)置、多樣的內(nèi)容展現(xiàn)形式。管理系統(tǒng)同時(shí)提供個(gè)性化、自定義報(bào)表輸出功能。

高性能計(jì)算系統(tǒng)平臺(tái)軟件：

PHPC 100提供了各種高性能計(jì)算各類(lèi)系統(tǒng)軟件，并針對(duì)PHPC 100完成了軟件的優(yōu)化。包括：
并行環(huán)境：各類(lèi)MPI（包括MPI 1和MPI 2）、PVM等
編譯器：GNU C/C++、GNU Fortran、GFortran等
數(shù)學(xué)庫(kù)：ACML、GOTOBLAS、LAPACK、ScaLAPACK、FFTW等
基準(zhǔn)測(cè)試工具：Linpack、PMB、Stream等
高性能應(yīng)用軟件：
PHPC 100提供了各個(gè)應(yīng)用領(lǐng)域中，高性能計(jì)算最常用的部分軟件，并針對(duì)PHPC 100完成了軟件的優(yōu)化。使得很多用戶(hù)無(wú)需在安裝、調(diào)試、優(yōu)化應(yīng)用軟件，在拿到PHPC以后，直接使用即可。
高性能應(yīng)用軟件包括序列比對(duì)類(lèi)、分子動(dòng)力學(xué)類(lèi)、分子對(duì)接和藥物設(shè)計(jì)類(lèi)、氣象類(lèi)、有限元計(jì)算類(lèi)、材料類(lèi)、計(jì)算物理類(lèi)、計(jì)算化學(xué)類(lèi)等軟件。

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