Geneformics D基于Geneformics與以色列魏茨曼研究所共同研發(fā)的無損壓縮技術(shù),可為基因組云端程序提供企業(yè)級的基礎(chǔ)設(shè)施服務(wù)(IaaS)。運(yùn)用Geneformics D技術(shù),從人群測序、基因庫、遺傳、罕見疾病、癌癥和基因組學(xué)藥物治療研究中提取的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)可被自動壓縮,這一過程對用戶透明,從而高效地節(jié)省時間,帶寬及大量存儲空間。

Geneformics CEO Rafael Feitelber 表示:“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)正在促使醫(yī)療及研究機(jī)構(gòu)將基因組數(shù)據(jù)分析過程從本地向云端架構(gòu)遷移, 因?yàn)樵贫思軜?gòu)的高可擴(kuò)展性,共享性和易用性更具有吸引力。現(xiàn)在,通過Geneformics D技術(shù),相關(guān)機(jī)構(gòu)可以通過云端高可擴(kuò)展的無縫基因組數(shù)據(jù)壓縮大大加快數(shù)據(jù)分析流程,減少儲存需求。

Geneformics公司的創(chuàng)始人兼CTO Arik Keshet表示:“單個人類全基因組測序的數(shù)據(jù)量大約為250-300GBGeneformics目前致力解決海量數(shù)據(jù)給第二代測序從業(yè)人員所帶來的巨大挑戰(zhàn)。通過使用Geneformics D技術(shù),經(jīng)壓縮的全基因組數(shù)據(jù)大小僅有原來的十分之一。同時,由于Geneformics D技術(shù)與底層架構(gòu)的無縫整合,使得用戶不需要改變?nèi)魏蔚臄?shù)據(jù)格式和應(yīng)用接口。

Geneformics D采用分布式的、云端壓縮文件系統(tǒng),目前已整合至亞馬遜網(wǎng)絡(luò)服務(wù)(AWS,Geneformics D未來版本將會陸續(xù)整合其他云服務(wù)提供商。Geneformics D軟件安裝在每個計算實(shí)例上,協(xié)同實(shí)現(xiàn)一個對象即文件(object-as-file),經(jīng)過透明壓縮的Linux標(biāo)準(zhǔn)文件系統(tǒng)。Geneformics D動態(tài)解壓縮技術(shù)讓采用原生FASTQBAM格式的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用不需修改即可使用,從而保證對生物信息流程的影響最小。

其他Geneformics D功能包括:

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songjy

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