人人都在說“基因大數(shù)據(jù)”,有人說它是概念泡沫,有人說它是未來金礦。那么,基因大數(shù)據(jù)到底是什么?基因組云計算技術(shù)開發(fā)者大會10日在深圳召開。來自華大基因、阿里云、英特爾、百度開放云、華為、聚道科技、微基因等單位的技術(shù)開發(fā)者共同探討基因大數(shù)據(jù)的行業(yè)動態(tài),解讀技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),拓展基因組云計算的應(yīng)用領(lǐng)域。會上正式成立了“中國生物信息云計算產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟”,該聯(lián)盟將推進(jìn)以基因大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)的“精準(zhǔn)醫(yī)療”戰(zhàn)略規(guī)劃,并加快生物信息與云計算技術(shù)的融合,通過成員企業(yè)間的協(xié)作與交流,促進(jìn)產(chǎn)學(xué)研合作,推動整個產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。
基因數(shù)據(jù)樣本量尚嫌不足
基因測序為生命科學(xué)研究開辟了新的領(lǐng)域,而大數(shù)據(jù)的應(yīng)用則是學(xué)術(shù)研究轉(zhuǎn)化的基礎(chǔ)。深圳國家基因庫主任、華大農(nóng)業(yè)集團(tuán)董事長梅永紅表示,以大數(shù)據(jù)平臺為基礎(chǔ)的各類軟件、產(chǎn)品,將充分展示這一新興產(chǎn)業(yè)的活力與前景。而大數(shù)據(jù)平臺必須是協(xié)作共建的結(jié)果,開放和共享是大數(shù)據(jù)平臺生命力的源泉,并寄望基因測序、大數(shù)據(jù)平臺與更多的技術(shù)融合發(fā)展,期待基因組云計算體系的建構(gòu)與完善。
基因大數(shù)據(jù)能給老百姓帶來哪些實實在在的好處呢?“大家比較關(guān)心的是跟健康之間的關(guān)系?!蔽⒒騽?chuàng)始人CEO鄭強(qiáng)在接受記者采訪時表示,“我們認(rèn)為在一定數(shù)量下,在幾百萬或者幾千萬用戶級別下,能給大眾帶來的健康指導(dǎo)意見會有非常大的幫助。從統(tǒng)計和概率的角度來說,能夠為用戶提供決策的依據(jù),比如說做購買保險的決策、體檢的決策等等。”
鄭強(qiáng)說,基因大數(shù)據(jù)對于疾病健康風(fēng)險的預(yù)測和指導(dǎo),需要大樣本量,甚至百萬級的樣本來做對照,但從目前的情況來看,整個樣本量尚未達(dá)到一定程度。要挖掘基因大數(shù)據(jù)背后的價值,首先必須要獲得足夠的基因樣本量。
華大基因股份有限公司執(zhí)行總裁尹燁指出,生命本身是數(shù)字化的,每一個人都是大數(shù)據(jù)的載體。不久的將來,基因測序企業(yè)要考慮的不再是基因測序本身的成本,而是數(shù)據(jù)傳輸及存儲的成本。生物大數(shù)據(jù)還可以用于罕見疾病及腫瘤的診斷、治療和預(yù)防,農(nóng)業(yè)分子育種服務(wù),腸道菌群的調(diào)整指導(dǎo)等。
“牛企”合作共推產(chǎn)業(yè)發(fā)展
會上,華大基因、阿里云、百度開放云、華為、聚道科技、微基因聯(lián)合發(fā)起“中國生物信息云計算產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟”,該聯(lián)盟將推進(jìn)以基因大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)的“精準(zhǔn)醫(yī)療”戰(zhàn)略規(guī)劃,并加快生物信息與云計算技術(shù)的融合。聯(lián)盟的成立將聯(lián)合生物信息云計算行業(yè)內(nèi)的機(jī)構(gòu)企業(yè),秉承人類基因組計劃“共有、共享、共為”的協(xié)作精神,共同推動生物信息云計算領(lǐng)域的國內(nèi)外技術(shù)交流與創(chuàng)新,加快其在各領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用。同時,聯(lián)盟將積極主導(dǎo)和參與領(lǐng)域內(nèi)的國際標(biāo)準(zhǔn)、國家標(biāo)準(zhǔn)與行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的制定,保證行業(yè)發(fā)展健康有序。通過成員單位間的協(xié)作與交流,凝聚產(chǎn)業(yè)鏈上下游資源,促進(jìn)產(chǎn)學(xué)研合作,營造良好的產(chǎn)業(yè)發(fā)展環(huán)境。
百度開放云資深解決方案架構(gòu)師吳李知說,在該領(lǐng)域,有像百度、阿里、華為等幾家IT企業(yè),可以提供最底層的計算資源、基礎(chǔ)設(shè)施,有像聚道科技這樣的企業(yè)來提供數(shù)據(jù)分析服務(wù),有像微基因這樣的企業(yè)來提供個人測序服務(wù),也有像華大基因這樣的企業(yè)來推進(jìn)醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)等方方面面的研究與服務(wù),“各家企業(yè)從不同的層面、不同的角度共同合作,推進(jìn)行業(yè)發(fā)展”。
基因組、云計算是當(dāng)今炙手可熱的領(lǐng)域。基因測序或?qū)⒏靖淖兩镝t(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和醫(yī)療實踐,但由此產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也呈現(xiàn)出爆炸式的增長,也對海量數(shù)據(jù)的計算、存儲和分析提出新的挑戰(zhàn)。大會還發(fā)布了“風(fēng)云挑戰(zhàn)賽”,旨在通過公開競賽的形式,匯聚BT和IT領(lǐng)域的行業(yè)精英,以共同解決基因組學(xué)數(shù)據(jù)在大規(guī)模存儲、計算和知識積累等方面所面臨的挑戰(zhàn)。
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