此次,四方共同合作的“云之稻項(xiàng)目“,源自比爾梅琳達(dá)蓋茨基金“為非洲和亞洲資源貧瘠地區(qū)培育綠色超級(jí)稻”和國(guó)家國(guó)際合作專項(xiàng)資助的3000份水稻基因組項(xiàng)目的成果。根據(jù)協(xié)議,基于3000份水稻基因組測(cè)序數(shù)據(jù)和種質(zhì)資源的“云之稻項(xiàng)目”將無償共享,同時(shí)項(xiàng)目組還將建立水稻最全面的“水稻功能基因組和育種信息數(shù)據(jù)庫(kù)”,為基礎(chǔ)研究和育種應(yīng)用提供可供參考的重要信息。

綠色超級(jí)稻項(xiàng)目首席科學(xué)家、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所黎志康博士介紹說,該項(xiàng)目簡(jiǎn)稱為綠色超級(jí)稻項(xiàng)目,由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院牽頭組織實(shí)施,項(xiàng)目總體目標(biāo)是培育能夠廣泛適用于灌溉和雨養(yǎng)地區(qū)生態(tài)環(huán)境,并具有氮磷高效利用、抗病、抗蟲、高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗逆(干旱、鹽堿)等特性的水稻新品種,在目標(biāo)國(guó)家進(jìn)行示范和推廣,推動(dòng)雜交稻種子的生產(chǎn)能力,并為撒哈拉以南非洲國(guó)家、亞洲和中國(guó)的西南地區(qū)水稻分子育種建立一個(gè)高效水稻基因型分析技術(shù)平臺(tái)。

據(jù)透露,3000份水稻核心種質(zhì)基因組測(cè)序項(xiàng)目是迄今為止全世界最大的植物基因組測(cè)序項(xiàng)目。這項(xiàng)研究將加快規(guī)模化發(fā)掘水稻優(yōu)良基因,突破水稻復(fù)雜性狀分子改良的技術(shù)瓶頸,加快高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、廣適性新品種培育的進(jìn)程,全面提升我國(guó)及全球水稻基因組研究和分子育種水平。


 

在回答記者提問時(shí),黎志康博士表示,“對(duì)3000份水稻核心種質(zhì)基因組測(cè)序分析,能夠回答‘水稻有多少的遺傳多樣性可以應(yīng)用,從哪里獲取所生物育種需要的遺傳資源’的問題,分析得到的數(shù)據(jù)將為水稻的基礎(chǔ)認(rèn)識(shí)和生物育種提供基礎(chǔ)信息資源。這項(xiàng)研究將揭示全球栽培稻資源的基因組多樣性,和每個(gè)水稻資源的遺傳特點(diǎn)和其應(yīng)用價(jià)值。”

他進(jìn)一步補(bǔ)充說,這項(xiàng)研究將3000份水稻種質(zhì)資源帶入水稻育種應(yīng)用中,將為水稻育種創(chuàng)新提供材料和新思路。3000份水稻核心種質(zhì)重測(cè)序項(xiàng)目的分析結(jié)果還將填補(bǔ)人們對(duì)水稻甚至各個(gè)物種在基因組學(xué)方面的一些知識(shí)空缺。后基因組時(shí)代結(jié)合功能基因組學(xué)新的方法和策略進(jìn)行生物育種,將貢獻(xiàn)于糧食安全,食品健康的發(fā)展。

黎志康告訴記者,3000份水稻基因組測(cè)序項(xiàng)目分析得到的數(shù)據(jù)量達(dá)到幾百T,生物學(xué)研究進(jìn)入了大數(shù)據(jù)時(shí)代,需要全世界所有科學(xué)家和有興趣的人士參與進(jìn)來分析挖掘,阿里云將提供一個(gè)很好的平臺(tái),同時(shí)阿里云平臺(tái)結(jié)合眾多的科學(xué)研究人員也會(huì)促進(jìn)生物大數(shù)據(jù)行業(yè)的快速發(fā)展。

業(yè)內(nèi)專家指出,當(dāng)基因研究進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代,傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)共享模式和分析工具已經(jīng)遭遇到瓶頸,成為阻礙行業(yè)發(fā)展的一大痛點(diǎn)。

阿里云高級(jí)專家林河山表示,"水稻基因數(shù)據(jù)公益云平臺(tái)構(gòu)建在阿里云的對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù)和批量計(jì)算服務(wù)之上。阿里云的對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù)(簡(jiǎn)稱OSS)是阿里云自主研發(fā)的分布式存儲(chǔ)系統(tǒng),具備海量的存儲(chǔ)空間和幾乎無限的擴(kuò)容能力,并且通過多重?cái)?shù)據(jù)冗余備份和自動(dòng)的故障恢復(fù)機(jī)制保證數(shù)據(jù)安全。通過OSS提供的免費(fèi)存儲(chǔ)和下載服務(wù),Rice 3K項(xiàng)目的水稻基因組數(shù)據(jù)可以隨時(shí)為全球科學(xué)家所用。“

他還表示,“阿里云批量計(jì)算服務(wù)為數(shù)據(jù)的分析和解讀提供了海量的計(jì)算資源。批量計(jì)算服務(wù)是專門針對(duì)基因數(shù)據(jù)分析等計(jì)算密集型應(yīng)用設(shè)計(jì)的分布式云服務(wù),其自動(dòng)的資源管理、靈活的任務(wù)調(diào)度和工作流支持大大簡(jiǎn)化了在云上搭建水稻基因分析平臺(tái)的過程。"

阿里云方面表示,阿里云希望未來可以和更多的公共基因組項(xiàng)目合作,通過阿里云大數(shù)據(jù)相關(guān)服務(wù)與業(yè)界專家領(lǐng)域知識(shí)的緊密結(jié)合,共同推動(dòng)基因測(cè)序行業(yè)的變革。目前,阿里云已經(jīng)與貝瑞和康、中科院計(jì)算研究所等國(guó)內(nèi)領(lǐng)先的基因公司以及研究機(jī)構(gòu)展開合作。

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