浪潮生命科學(xué)一體機(jī)

基因成為21世紀(jì)寶貴戰(zhàn)略資源

21世紀(jì)是眾所公認(rèn)的生命科學(xué)的世紀(jì)，基因已經(jīng)成為一種寶貴的戰(zhàn)略資源和財(cái)富，是未來(lái)國(guó)際間競(jìng)爭(zhēng)的焦點(diǎn)。而在基因研究領(lǐng)域，由生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)相結(jié)合形成的生物信息學(xué)，已經(jīng)成為揭示大量復(fù)雜生物數(shù)據(jù)潛藏奧秘的支撐性學(xué)科之一，其發(fā)展關(guān)乎基因研究的速度和成果。

數(shù)據(jù)處理難題制約基因研究

目前，基因測(cè)序技術(shù)呈現(xiàn)快速發(fā)展的勢(shì)頭，第二代測(cè)序技術(shù)可以一次完成數(shù)萬(wàn)至數(shù)百萬(wàn)條DNA分子的序列測(cè)定，使得科學(xué)家在極短時(shí)間內(nèi)對(duì)人類(lèi)基因組進(jìn)行細(xì)致研究成為可能。不過(guò)，這也改變了原本基因研究中“測(cè)序沒(méi)有處理快”的局面，大量的測(cè)序數(shù)據(jù)得不到及時(shí)處理，嚴(yán)重影響了基因研究進(jìn)程和成果涌現(xiàn)。造成這一瓶頸的原因，其中既有數(shù)據(jù)處理平臺(tái)計(jì)算力和計(jì)算效率不足的因素，更重要的在于基因測(cè)序軟件使用門(mén)檻較高。

浪潮高性能計(jì)算總經(jīng)理劉軍表示，每種測(cè)序技術(shù)對(duì)應(yīng)的生物信息學(xué)的分析方法存在或多或少的差異，而每種分析方法都有特定的流程，會(huì)涉及到7-8種分析軟件。一方面，軟件種類(lèi)的復(fù)雜導(dǎo)致部署繁瑣、周期延長(zhǎng)、管理困難;另一方面，較高的專(zhuān)業(yè)性也導(dǎo)致無(wú)計(jì)算機(jī)或生物信息學(xué)基礎(chǔ)的人員很難勝任數(shù)據(jù)分析工作。這些問(wèn)題大大限制了數(shù)據(jù)分析的速度，制約著生物信息學(xué)科的發(fā)展以及應(yīng)用。因此，開(kāi)發(fā)一種易操作的生物信息學(xué)分析的軟硬一體化平臺(tái)，已經(jīng)成為加快基因數(shù)據(jù)分析速度，更好推動(dòng)我國(guó)基因戰(zhàn)略發(fā)展的當(dāng)務(wù)之急。

浪潮生命科學(xué)一體機(jī)“一鍵式”提升基因研究效率

據(jù)介紹，浪潮生命科學(xué)一體機(jī)的生物信息平臺(tái)后臺(tái)由浪潮服務(wù)器支撐，集成了基本的生物信息學(xué)工具，如Bowtie、Bwa等二代測(cè)序的比對(duì)工具， Fastqc等數(shù)據(jù)預(yù)處理工具等，能夠進(jìn)行全基因組重測(cè)序等二代測(cè)序的數(shù)據(jù)分析。完善的軟件組合使得用戶(hù)可以根據(jù)實(shí)際研發(fā)需求，自定義數(shù)據(jù)處理流程并實(shí)現(xiàn)一鍵式運(yùn)行，在大幅降低部署、優(yōu)化時(shí)間的同時(shí)，也通過(guò)“傻瓜式”操作降低了使用門(mén)檻。此外，瀏覽器登陸訪問(wèn)功能，使得操作人員不再受工作地點(diǎn)的限制，實(shí)現(xiàn)移動(dòng)辦公。

據(jù)介紹，浪潮生命科學(xué)一體機(jī)將持續(xù)收集基因數(shù)據(jù)，豐富測(cè)序比對(duì)和數(shù)據(jù)處理工具，為基因研究的用戶(hù)提供便利，并致力于成為我國(guó)基因研究的重要平臺(tái)型裝備，為我國(guó)在該領(lǐng)域取得領(lǐng)先優(yōu)勢(shì)提供更好的支撐。

sunyingying