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浪潮發(fā)布生命科學(xué)一體機(jī) 基因研究也能“一鍵式”

浪潮 發(fā)表于:14年10月30日 00:23 [來(lái)稿] DOIT.com.cn

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[導(dǎo)讀]為加速我國(guó)基因科學(xué)研究的進(jìn)程,浪潮于日前正式推出生命科學(xué)一體機(jī)。這一產(chǎn)品的問(wèn)世,將使國(guó)內(nèi)生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)能夠獲得低成本、高效率的基因分析處理平臺(tái),更有效的開(kāi)發(fā)和利用我國(guó)豐富的基因資源,加速我國(guó)基因戰(zhàn)略的發(fā)展。

為加速我國(guó)基因科學(xué)研究的進(jìn)程,浪潮于日前正式推出生命科學(xué)一體機(jī)。這一產(chǎn)品的問(wèn)世,將使國(guó)內(nèi)生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)能夠獲得低成本、高效率的基因分析處理平臺(tái),更有效的開(kāi)發(fā)和利用我國(guó)豐富的基因資源,加速我國(guó)基因戰(zhàn)略的發(fā)展。

浪潮生命科學(xué)一體機(jī)

基因成為21世紀(jì)寶貴戰(zhàn)略資源

21世紀(jì)是眾所公認(rèn)的生命科學(xué)的世紀(jì),基因已經(jīng)成為一種寶貴的戰(zhàn)略資源和財(cái)富,是未來(lái)國(guó)際間競(jìng)爭(zhēng)的焦點(diǎn)。而在基因研究領(lǐng)域,由生命科學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)相結(jié)合形成的生物信息學(xué),已經(jīng)成為揭示大量復(fù)雜生物數(shù)據(jù)潛藏奧秘的支撐性學(xué)科之一,其發(fā)展關(guān)乎基因研究的速度和成果。

數(shù)據(jù)處理難題制約基因研究

目前,基因測(cè)序技術(shù)呈現(xiàn)快速發(fā)展的勢(shì)頭,第二代測(cè)序技術(shù)可以一次完成數(shù)萬(wàn)至數(shù)百萬(wàn)條DNA分子的序列測(cè)定,使得科學(xué)家在極短時(shí)間內(nèi)對(duì)人類基因組進(jìn)行細(xì)致研究成為可能。不過(guò),這也改變了原本基因研究中“測(cè)序沒(méi)有處理快”的局面,大量的測(cè)序數(shù)據(jù)得不到及時(shí)處理,嚴(yán)重影響了基因研究進(jìn)程和成果涌現(xiàn)。造成這一瓶頸的原因,其中既有數(shù)據(jù)處理平臺(tái)計(jì)算力和計(jì)算效率不足的因素,更重要的在于基因測(cè)序軟件使用門檻較高。

浪潮高性能計(jì)算總經(jīng)理劉軍表示,每種測(cè)序技術(shù)對(duì)應(yīng)的生物信息學(xué)的分析方法存在或多或少的差異,而每種分析方法都有特定的流程,會(huì)涉及到7-8種分析軟件。一方面,軟件種類的復(fù)雜導(dǎo)致部署繁瑣、周期延長(zhǎng)、管理困難;另一方面,較高的專業(yè)性也導(dǎo)致無(wú)計(jì)算機(jī)或生物信息學(xué)基礎(chǔ)的人員很難勝任數(shù)據(jù)分析工作。這些問(wèn)題大大限制了數(shù)據(jù)分析的速度,制約著生物信息學(xué)科的發(fā)展以及應(yīng)用。因此,開(kāi)發(fā)一種易操作的生物信息學(xué)分析的軟硬一體化平臺(tái),已經(jīng)成為加快基因數(shù)據(jù)分析速度,更好推動(dòng)我國(guó)基因戰(zhàn)略發(fā)展的當(dāng)務(wù)之急。

浪潮生命科學(xué)一體機(jī)“一鍵式”提升基因研究效率

據(jù)介紹,浪潮生命科學(xué)一體機(jī)的生物信息平臺(tái)后臺(tái)由浪潮服務(wù)器支撐,集成了基本的生物信息學(xué)工具,如Bowtie、Bwa等二代測(cè)序的比對(duì)工具, Fastqc等數(shù)據(jù)預(yù)處理工具等,能夠進(jìn)行全基因組重測(cè)序等二代測(cè)序的數(shù)據(jù)分析。完善的軟件組合使得用戶可以根據(jù)實(shí)際研發(fā)需求,自定義數(shù)據(jù)處理流程并實(shí)現(xiàn)一鍵式運(yùn)行,在大幅降低部署、優(yōu)化時(shí)間的同時(shí),也通過(guò)“傻瓜式”操作降低了使用門檻。此外,瀏覽器登陸訪問(wèn)功能,使得操作人員不再受工作地點(diǎn)的限制,實(shí)現(xiàn)移動(dòng)辦公。

據(jù)介紹,浪潮生命科學(xué)一體機(jī)將持續(xù)收集基因數(shù)據(jù),豐富測(cè)序比對(duì)和數(shù)據(jù)處理工具,為基因研究的用戶提供便利,并致力于成為我國(guó)基因研究的重要平臺(tái)型裝備,為我國(guó)在該領(lǐng)域取得領(lǐng)先優(yōu)勢(shì)提供更好的支撐。

[責(zé)任編輯:孫瑩瑩]
淅西
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